В 2008 году «Байер» купил и преобразовал женскую футбольную команду «Кельн». Так началась история женского футбола в Леверкузене.
Через два года команда смогла подняться из второй Бундеслиги в первую. На данный момент в первой Бундеслиге самое высокое место (5) по итогам сезона команда заняла по окончании сезона 2020/21.
К сожалению, результат сезона 2016/17 оказался неутешительным и команда вылетела во вторую лигу победив всего в двух матчах в том году. Однако пребывание во второй лиге оказалось недолгим, уже через сезон «Байер» вернулся в элиту немецкого женского футбола.
