В 1989 году после завершения карьеры он возвращается в Корею. С 1990 года Ча становится главным тренером клуба «Ульсан Хёндэ», тогда называвшейся «Хёндэ Хоранг И». С 1991 он становится ещё и президентом клуба. На этой должности он находился до 1994 года. Параллельно на выделяемые «Байером» деньги, создает собственную детскую спортивную школу. В 1994 году он уходит с поста тренера, сосредотачиваясь на работе в организационном комитете, задачей которого было заполучить проведение Кубка мира. Как мы знаем, с этой задачей он справился успешно.
В 1997 году Ча становится главным тренером сборной. Сборная прорывается на французский мундиаль, где от неё ждут минимум выхода из группы. Но, вначале ведя в счете, команда уступает мексиканцам 1:3, затем бездарная игра против голландцев закончившаяся унизительным поражением 0:5. После него Бум Кун Ча пишет заявление об уходе. На последнюю игру с Болгарией 1:1, команду выводил уже новый главный тренер.
Не желая некоторое время появляться в своей стране, Бум Кун Ча становится тренером китайского клуба «Шиньян Пинган». Однако с 2000 года он возвращается в Корею, где возобновляет свое участие в организационном комитете Кубка мира в качестве консультанта. Также консультантом он числится и в сборной, являясь, наряду с Гуусом Хиддинком одним из создателей «корейского чуда». Команда, за которую, кстати, играл сын Бум Кун Ча, заняла на мундиале 4-е место.
Ча повезло больше в работе с клубными командами. Под его руководством команда «Сувон», в которой он провел период 2003-2010 гг, дважды добилась успеха в чемпионате Южной Корее. 6 июня 2010 года Бум Кун подал в отставку и с тех пор не выполняет каких-либо официальных функций в футболе.
Ча Бум Кун, несомненно, исключительный футболист. С японцем Ясухико Окудера, который на рубеже 70-х и 80-х годов защищал цвета «Кельна», «Герты» и «Вердера», он открыл путь для азиатов в европейские клубы. Неудивительно, что в 1999 году Ча был выбран лучшим азиатским футболистом XX века.
Ча является представителем социальных и спортивных программ концерна «Байер» в Азии, под его патронажем находится около 1000 молодых игроков, с которыми занимаются 11 тренеров. Всего у германского гиганта 29 подобных филиалов по всему миру. Также с 1991 года он работает на канале МВС (Munhwa Broadcasting Corporation), а с 2001 года ведет собственную комментаторскую программу.
Сегодня в Европе уже можно найти десятки игроков с самого густонаселенного континента мира. Одним из них является правый защитник «Селтика» Ча Ду Ри — сын Ча Бум Куна… Кстати Ча Ду Ри также успел поиграть за Байер, но в команде не задержался.